Yayasan Badan Wakaf Universitas Islam Indonesia (YBW UII) berdiri pada Ahad, 27 Rajab 1364 H bertepatan dengan tanggal 08 Juli 1945 M. Akta pendirian dibuat pada Sabtu, 23 Rabi’ul Awwal 1371 H bertepatan tanggal 22 Desember 1951 M dengan Akta Notaris RM Wiranto Nomor 19. YBW UII berkedudukan di Jalan Cik Di Tiro Nomor 1 Yogyakarta.
“Terwujudnya Yayasan sebagai badan penyelenggara pendidikan, sosial, keagamaan, dan kemanusiaan yang unggul dan berkelanjutan dengan komitmen pada kesempurnaan risalah Islamiyah, berasaskan Islam, dan berpedoman pada peraturan perundang-undangan yang berlaku.”
”Menyelenggarakan pendidikan, sosial, keagamaan, dan kemanusiaan yang mampu memandu dan mengantarkan umat sebagai khairu ummah (umat unggulan) sehingga tercipta negeri Indonesia yang sejahtera dan penuh ampunan Tuhan (Baldatun Thayyibatun wa Rabbun Ghafur).”
